Die einheimischen Fledermäuse sind Wirte einer Anzahl von Parasiten. Der Lebenszyklus dieser Parasiten ist zumeist auf ein spezielles Wirtstier abgestimmt, das zum Blutsaugen gefunden werden muss, damit die Art eine Überlebenschance hat. Im Rahmen des Fledermausschutzes werden auch Daten zu den folgenden Fledermausparasiten erhoben, um so mehr über die zoologischen und biologischen Zusammenhänge zu erfahren.

• Fledermaus-Fliegen (Familie Nycteribiidae)
• Fledermaus-Wanzen (Familie Cimicidae)
• Fledermaus-Flöhe (Familie Ischnopsyllidae)
• Fledermaus-Zecken (Familien Argasidae und Ixodidae)
Flughautmilben der Gattung Spinturnix auf der Flughaut eines Großen Abendseglers
(Foto: Klaus Bogon, Kassel)